NGFN-PLUS

Quantitative Proteomics

Leitung:    PD Dr. Gerard Drewes
Institut: Cellzome AG
Homepage: www.cellzome.com
Ziel dieses Teilprojekts ist es Erkenntnisse zu erhalten, ob in einem Tumor mutierte Proteine eine veränderte Zusammensetzung der zellulär assoziierten Proteinkomplexe aufweisen. Hierzu soll eine Auswahl der im IG-Mutanom identifizierten Mutanten einer quantitativen Interaktomanalyse unterzogen werden. Mittels moderner Protein-Analyse Methoden sollen dazu in einem ersten Schritt native Proteinkomplexe aus Zellkulturen isoliert werden, die vom jeweiligen tumorrelevanten Target-Protein ausgebildet werden. Im nächsten Schritt wird durch eine quantitative massenspektrometrische Analyse sowohl die Identität der Komplexkomponenten als auch die relative Menge der identifizierten Proteine bestimmt. Im direkten Vergleich des Wildtyp-Proteins und der Mutante können so quantitative Unterschiede in der Zusammensetzung der Komplexe ermittelt werden. Darüber hinaus sollen Protein-Expressionsprofile von Krebs-relevanten Modell-Zelllinien mittels quantitativer Massenspektrometrie erarbeitet werden. Daraus können dann die molekularen Ursachen der veränderten Signaleigenschaften des mutierten Proteines direkt abgeleitet werden. Unter Einbeziehung weiterer Daten des IG-Mutanom sollen dann immunoaffinitätsbasierte Testverfahren am Tumorgewebe entwickelt werden. Solche Testverfahren können später für diagnostische Zwecke und in der Wirkstofffindung Anwendung finden.


Weiterer relevanter Internet-Link:
The Mutanom project
Weitere Teilprojektleiter: