NGFN-PLUS

Datenmanagement

Leitung:    Prof. Dr. Martin Hrabé de Angelis
Institut: Institut für Experimentelle Genetik, Helmholtz Zentrum München
Homepage: www.helmholtz-muenchen.de/en/ieg
Das Subprojekt Datenmanagement spielt für die Arbeit aller Subprojekte der GMC und des deutschen EMMA Knotens eine zentrale und essentielle Rolle. Es ist an allen Schritten der Verarbeitung wissenschaftlicher Daten von der Erfassung und Speicherung in Datenbanken über die statistische Auswertung und Visualisierung bis hin zur semi-automatischen Übertragung der Ergebnisse in Berichte und öffentliche Datenbanken und die Darstellung auf der GMC Webseite beteiligt. Die für eine effektive Zusammenarbeit der GMC Subprojekte erforderlichen Software Anwendungen wie ein integriertes Maus- und Laborverwaltungssystem, sowie Systeme für die Verwaltung kryoarchivierter Proben und die Planung der Arbeitsschritte und der komplexen Logistik wurden im Rahmen des Projektes selbst entwickelt. Die Konzepte unseres Mausverwaltungssystems (MausDB) wurden veröffentlicht und als Software mit freiem Quellcode und ausführlicher Dokumentation der wissenschaftlichen Gemeinschaft zum kostenlosen Download zur Verfügung gestellt. Mindestens 15 Einrichtungen weltweit nutzen bereits unsere Software Anwendungen erfolgreich. Unsere Anwendungen werden ständig weiter verbessert und modular miteinander vernetzt. Das Teilprojekt Datenmanagement umfasst darüber hinaus wichtige Aspekte wie Datenpflege und Qualitätskontrolle bei der Datensammlung und Verarbeitung sowie die Übersetzung von Rohdaten in Begriffe wie zum Beispiel Ontologie Terme, die eine Voraussetzung für einen Spezies-übergreifenden Vergleich von Forschungsergebnissen darstellen. Bioinformatiker des Teilprojektes Datenmanagement sind an europäischen und internationalen Hochdurchsatz-Projekten der Maus-Phänotypisierung und der Datenintegration und Standardisierung der Datensammlung beteiligt.
                    


Weitere relevante Internet-Links:
The German Mouse Clinic
Weitere Teilprojektleiter: