Systematische Analyse von Phänotypen mittels RNAi und kleinen Molekülen

Leitung:		Prof. Dr. Michael Boutros
Institut:		DKFZ Heidelberg
Homepage:		www.dkfz.de/signaling/

Das Ziel des Vorhabens ist eine systembiologische Analyse von Signalwegen, die in neurodegenerativen Krankheiten eine wichtige Rolle spielen. Diese Signalwege sollen mithilfe von Gen-Phänotyp-Profilen systematisch untersucht werden mit dem Ziel funktionelle Module zu identifizieren. Das Teilprojekt wird sich auf Signalwegen fokussieren, die eine direkte Relevanz für neurodegenerative Erkrankungen haben. 
In einem ersten Schritt werden zell-basierte Assays etabliert und optimiert, die zur Identifizierung von neuen Targets mittels RNAi Screenings eingesetzt werden sollen. Ein weiteres Ziel des Projektes ist die Identifizierung von neuen kleinen Molekülen, die selektiv Signalwege inhibieren. Mittels bioinformatischer Verfahren werden diese Datensätze mit Protein-Protein Interaktionen integriert, um krankheitsrelevante Targets und neue Signalwegs-Module zu identifizieren.
Die Identifizierung von neuen Targets und deren Einbettung in Signalnetzwerke haben eine hohe Bedeutung für die Entwicklung von spezifischen Therapie-Ansätzen.

                 
   
                                

RNAi Screening.
Zell-basierte Hochdurchsatz-RNAi-Experimente werden im
384-Lochplatten-Format durchgeführt. Hier gezeigt ist ein einzelnes
Ausleseergebnis, wobei sich die Signalintensitäten auf die Vitalität der Zellen beziehen, welche mit verschiedenen RNAi Molekülen behandelt wurden.