Subgenomfraktionierung für die individuelle Sequenzierung

Der Verbund entwickelt eine universell einsetzbare Technologie zur Reduktion der Komplexität eukaryontischer Genome für die Hochdurchsatzsequenzierung (Next Generation Sequencing). Die gezielte Isolierung spezifischer genomischer Bereiche im Rahmen der Probenvorbereitung wird die Entschlüsselung komplexer Genome, wie z. B. das des Menschen, durch Hochdurchsatzsequenzierungstechnologien vorantreiben und diese entscheidend effizienter und kostengünstiger gestalten. Die zu entwickelnde Technologie beruht auf einer Fraktionierung der Genome: eine spezifische Anreicherung gewünschter genomischer Elemente oder Regionen erfolgt durch Oligonukleotid-Mikroarray basierte Hybridisierung. Eine Anwendung der Technologie ist im klinischen und biomedizinischen Bereich vorgesehen. Die Validierung und weitere Optimierung der Selektionstechnologie erfolgt anhand klinisch relevanter Proben (Krebs, Herzerkrankungen, Parkinson) und ist für verschiedene Sequenzierungsplattformen vorgesehen. Schwerpunkte der Anwendungsentwicklung liegen in den Bereichen Mutations-, SNP- und Promotoranalysen durch Nano-Bisulfit-Sequenzierung.