NGFN-PLUS
Genidentifizierung und Produktion von DNA-Konstrukten
| Leitung: | Prof. Dr. Francis Stewart | |
| Institut: | Biotechnologisches Zentrum der Technischen Universität Dresden | |
| Homepage: | www.biotec.tu-dresden.de/stewart |
Ziel von TP1 ist das Erstellen und die Pflege der DiGtoP Kandidatengenliste sowie die Herstellung korrespondierender DNA Reagenzien, welche markierte BAC-Transgene und Targeting-Konstrukte enthalten.
Die DiGtoP Kandidatengenliste setzt sich wie folgt zusammen:
1. von den Antragstellern nominierte Gene; diese stellen den Ausgangspunkt für die Proteomanalyse der häufigsten Krankheits- und Therapiegebiete dar
2. von anderen NGFN Verbünden vorgeschlagene Gene
3. aus Genen, die bereits als proteomische Bindungspartner der unter Punkt 1 und 2 genannten Gene identifiziert wurden.
Wir erwarten, dass nach einer Anfangsphase die meisten Kandidatengene aus der 3. Kategorie stammen werden, dass aber auch Kapazitäten für neue Vorschläge aus der Wissenschaftsgemeinschaft bestehen. Sequentielles Tagging zur Proteomnavigation ist für den Erfolg von DiGtoP von zentraler Bedeutung, da die wechselseitige Validierung der Interaktionen die systematische Kartierung des Proteoms gewährleistet.
Die Kandidatengenliste wird von TP1 gepflegt und regelmäßig auf den neuesten Stand gebracht; die Genliste wird auf der DiGtoP Webseite für die Öffentlichkeit verfügbar sein. Zur Aktualisierung der Genliste werden außerdem in regelmäßigen Abständen andere NGFN IGs konsultiert. BAC-Transgene und promotorlose Targeting-Konstrukte für das C-terminale Protein Tagging werden in einer 96-well Recombineering-Pipeline für alle ausgewählten Gene generiert. Die DNA Reagenzien werden den Teilprojekten 4 und 5 zur BAC-Transgenese und dem Teilprojekt 4 für das Gene Targeting zur Verfügung gestellt.
Ein weiteres Ziel von Teilprojekt 1 ist die Entwicklung von DNA Komponenten und molekularen Werkzeugen, um die obengenannten Strategien weiter auszubauen.
weiterer relevanter Internet-link:
DiGtoP
Die DiGtoP Kandidatengenliste setzt sich wie folgt zusammen:
1. von den Antragstellern nominierte Gene; diese stellen den Ausgangspunkt für die Proteomanalyse der häufigsten Krankheits- und Therapiegebiete dar
2. von anderen NGFN Verbünden vorgeschlagene Gene
3. aus Genen, die bereits als proteomische Bindungspartner der unter Punkt 1 und 2 genannten Gene identifiziert wurden.
Wir erwarten, dass nach einer Anfangsphase die meisten Kandidatengene aus der 3. Kategorie stammen werden, dass aber auch Kapazitäten für neue Vorschläge aus der Wissenschaftsgemeinschaft bestehen. Sequentielles Tagging zur Proteomnavigation ist für den Erfolg von DiGtoP von zentraler Bedeutung, da die wechselseitige Validierung der Interaktionen die systematische Kartierung des Proteoms gewährleistet.
Die Kandidatengenliste wird von TP1 gepflegt und regelmäßig auf den neuesten Stand gebracht; die Genliste wird auf der DiGtoP Webseite für die Öffentlichkeit verfügbar sein. Zur Aktualisierung der Genliste werden außerdem in regelmäßigen Abständen andere NGFN IGs konsultiert. BAC-Transgene und promotorlose Targeting-Konstrukte für das C-terminale Protein Tagging werden in einer 96-well Recombineering-Pipeline für alle ausgewählten Gene generiert. Die DNA Reagenzien werden den Teilprojekten 4 und 5 zur BAC-Transgenese und dem Teilprojekt 4 für das Gene Targeting zur Verfügung gestellt.
Ein weiteres Ziel von Teilprojekt 1 ist die Entwicklung von DNA Komponenten und molekularen Werkzeugen, um die obengenannten Strategien weiter auszubauen.
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