Protein-Protein-Wechselwirkungsnetzwerke neurodegenerativer Erkrankungen

Leitung:		Prof. Dr. Erich Wanker
Institut:		Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin (MDC) Berlin-Buch
Homepage:		www.mdc-berlin.de

Das Teilprojekt konzentriert sich auf die Gewinnung und bioinformatische Analyse von Protein-Protein-Wechselwirkungen (PPI). Diese Daten sollen dann mit den Ergebnissen von Expressionsstudien und RNAi-Experimenten der Konsortialpartner kombiniert werden. Mit Hilfe der Interaktionsdaten sollen funktionelle Module identifiziert werden, die eine essenzielle Rolle in der Pathogenese neurodegenerativer Erkrankungen spielen. Außerdem werden computergestützte Methoden entwickelt, um aus den PPI-Daten potenzielle Krankheitsmodulatoren vorzuschlagen, die dann experimentell überprüft werden.

Es wurden 1000 Targetproteine aus 53 neurodegenerativen Erkrankungen für systematische Interaktionsstudien ausgewählt. Für diese Proteine sollen mit verschiedenen Y2H-Technologien Interaktionspartner identifiziert werden. Zusätzlich werden massenspektrometrische Untersuchungen für die Identifikation von Proteinkomplexen durchgeführt. Gefundene PPIs werden mittels Pull-down, Ko-Immunopräzipitationen und funktionalen Assays überprüft. Topologische und ontologische Kriterien erlauben Qualitätseinstufungen der PPI.

Die Ergebnisse erweitern unser Wissen über diagnostische und therapeutische Targets und ermöglichen Hypothesen über neue Therapieansätze..