NGFN-TRANSFER

Multiplex-Analyse von Protein-Signaturen in Formalin-fixiertem Brustkrebsgewebe

Leitung:    Dr. Peter Porschewski
Institut: Qiagen GmbH
Homepage: www1.qiagen.com/
Das Ziel des Qiagen Teilprojektes besteht in der sensitiven und quantitativen Proteom-Analyse von FFPEGeweben aus der klinischen Routine. Formalin-fixierte Gewebe konnten bis jetzt nicht für Routine-Methoden wie 2D-PAGE Analysen zugänglich gemacht werden. Dazu soll basierend auf dem von Qiagen vermarkteten Qproteome™ FFPE Tissue Kit eine Anpassung bzw. Optimierung der in der Kooperation zwischen dem Institut für Pathologie der Technischen Universität München (Prof. Dr. Karl-Friedrich Becker) und der Qiagen GmbH (Dr. Peter Porschewski) entwickelten Methode erfolgen, die die Verwendung und Analyse von FFPE-Lysaten in einem systematischen multiplex 2D Ansatz ermöglicht. Differenziell exprimierte Proteine werden analysiert und mit vorliegenden Daten klinischer Parameter verglichen. Die Ergebnisse dieses Vorhabens werden in die Entwicklung von Antikörpern für die Charakterisierung und Validierung dieser Kandidaten einfließen. Geeignete Antikörper können für die Entwicklung diagnostischer Tests verwendet werden (z.B. Outlicensing). Diese Entwicklung ist nicht Teil des Forschungsvorhabens.