Parallelisierte funktionelle Charakterisierung

Leitung:		PD Dr. Malte Buchholz
Institut:		Philipps-Universität Marburg, Klinik für Innere Medizin SP Gastroenterologie
Homepage:		www.uni-marburg.de

In vorausgegangenen Hochdurchsatz-Genexpressionsstudien mit Pankreaskarzinomgeweben und –zelllinien haben wir ca. 2000 Kandidatengene ausgewählt, die anschließend mit Hilfe von Kandidatengen-Arrays weiter charakterisiert wurden. Nach bioinformatischer Evaluation der Ergebnisse und funktioneller Annotation der Genprodukte wurden 80 Kandidatengene identifiziert, die mit großer Wahrscheinlichkeit wichtige biologische Funktionen innehaben und/oder als diagnostische oder therapeutische Ziele besonders geeignet sind. Diese Auswahl von Genen wird ergänzt werden durch die Gene, die in dem initialen Experten-„Jamboree“ innerhalb dieses IG ausgewählt werden. In diesem Teilprojekt werden wir die ‚Reverse Transfection Array’-Technologie nutzen, um diese ausgewählten Kandidatengene in hoch-parallelisierten funktionellen Assays experimentell zu charakterisieren. Auf diese Weise werden wir Gene identifizieren, die entscheidend zur Tumorprogression beitragen, d.h. zentrale Rollen in der Proliferation, Invasion, Metastasierung, Apoptose-Resistenz o.ä. spielen. Einzelne selektierte Gene werden darüber hinaus weitergehend detailliert charakterisiert, wobei sowohl in-vitro-Modelle als auch die im TP2 bereitgestellten in-vivo-Modelle zum Einsatz kommen.