Analyse von Mutationen und epigenetischen Veränderungen im Prostatakarzinom 

Leitung:		Dr. Dr. Michal-Ruth Schweiger
Institut:		Max Planck Institut für Molekulare Genetik
Homepage:		www.molgen.mpg.de/

Ziel dieses Projektes ist es, systematisch genomweite Untersuchungen zu Mutationen und epigenetischen Veränderungen in Prostata Tumor Patienten durchzuführen, und sie mit CGH Array und SNP Chip Analysen (SP2) sowie Veränderungen in der Expression von miRNA, mRNA (SP5) und Proteinen (SP6) zu korrelieren. Als Kerntechnik soll die vor kurzem entwickelte Hochdurchsatz-Sequenziertechnik (Solexa, 454) verwendet werden. Dazu werden zunächst DNA-Regionen durch eine sequenzspezifische Hybridisierung bzw. methylierte DNA mit Hilfe eines methyl-CpG- Antikörpers angereichert und anschließend sequenziert. Die erhaltenen Daten können einerseits direkt als prognostische Marker verwendet werden, andererseits wird eine Integration mit Ergebnissen aus anderen Arbeitsbereichen dieses Projekts angestrebt, die zu einer Erhöhung der Sensitivität und Spezifität der einzelnen Marker führen wird. Durch die enge Zusammenarbeit mit klinischen Partnern wird es des weiteren möglich sein, potentielle Biomarker für eine frühzeitige Diagnosestellung als auch eine differenzierte Stadieneinteilung von Prostatatumoren in prospektiven klinischen Studien zu testen.