Datenanalyse und Datenintegration

Leitung:		Prof. Dr. Hans Lehrach
Institut:		Max Planck Institut für molekulare Genetik, Berlin
Homepage:		www.molgen.mpg.de/~lh_bioinf

Das IA “Development and validation of new diagnostic, preventive and therapeutic tools for the prevention of cardiovascular diseases and disorders (CVD) in chronic renal failure (CRF)” setzt neue Methoden der Proteomik, Metabolomik, Genotypisierung und Peptidanalyse ein, um Mediatoren und deren Wirkmechanismen zu identifizieren, die für die vermehrte Inzidenz kardiovaskulärer Erkrankungen bei chronisch-niereninsuffizienten Patienten verantwortlich sind.

Dazu wird in einer longitudinalen klinischen Studie Patientenmaterial mit verschiedenen molekularen Methoden untersucht, um
(A) bekannte Mediatoren kardiovaskulärer Erkrankungen mit entsprechenden Bioassays zu charakterisieren und
(B) um unbekannte Mediatoren zu identifizieren.

Ziele des Teilvorhabens 4 ("Data analysis and data integration") sind:
(1) die Integration der Projektdaten in ein einheitliches System, um die verschiedenen molekularen Datentypen miteinander vergleichbar und der statistischen Analyse zugänglich zu machen, sowie die Entwicklung einer Nutzerschnittstelle zur gezielten Abfrage und Suche nach Daten,
(2) das experimentelle Design von Patientenkohorten, um eine optimale Güte der statistischen Verfahren zu erreichen sowie die Korrelationsanalyse der molekularen und Patientendaten,
(3) die statistische Auswertung der Daten und die Entwicklung von multivariaten statistischen Methoden, insbesondere der Klassifizierung, zur Identifizierung von prädiktiven Mustern für CVD in CKD Patienten und
(4) die Entwicklung einer Knowledgebase zur Visualisierung und Repräsentation der Projektergebnisse.