Identifizierung von Spleiß-Varianten, miRNA Analysen und Validierung

Leitung:		PD Dr. Holger Sültmann
Institut:		Deutsches Krebsforschungszentrum
Homepage:		www.dkfz.de

TP5 hat zum Ziel, validierte Gene, miRNA Marker und Signaturen zur Erkennung von klinisch relevantem Prostatakrebs beizutragen. Aufbauend auf die Erkenntnisse der Genexpressionsanalyse werden Microarray-basierte Experimente durchgeführt, die Assoziationen von Spleißvarianten und miRNAs mit der Progression von Prostatakrebs aufdecken sollen. Die Genexpressionsprofile werden mit der Datenbank connectivity map (http://www.broad.mit.edu/cmap/) abgeglichen, um potenzielle therapeutische Interventionen zu identifizieren. Mit Hilfe der RNA Interferenz (RNAi) Methode in Prostatakrebs-Zelllinien und nachfolgenden Microarray-Analysen sollen Geninteraktionsnetzwerke im Prostatakrebs generiert werden. Die Microarray-Daten werden hierfür zur Netzwerk-Modellierung in das Teilprojekt TP13 integriert. Zusammen mit den Resultaten der genomischen Analyse (TP2) sollen neue tumorassoziierte Gene identifiziert werden, die in den Teilprojekten TP4 (Mutations- und Methylierungsstatus), TP9 (Serumproteine), TP11 (zelluläre Funktion) und TP12 (organische Funktion) detailliert charakterisiert werden.




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