Molekulare Phänotypisierung in der Deutschen Mausklinik

Leitung:		PD Dr. Johannes Beckers
Institut:		Institut für Experimentelle Genetik, Helmholtz Zentrum München
Homepage:		www.helmholtz-muenchen.de/en/ieg

Die routinemäßige Analyse genomweiter RNA-Expressionsprofile in Organen von Mausmutanten und damit die molekulare Beschreibung von Modellen für humane Erkrankungen sind die Ziele der Molekularen Phänotypisierung innerhalb der Deutschen Mausklinik. Zur standardisierten Expressionsanalyse verwenden wir kommerzielle Illumina Bead Arrays, die ca. 44.000 Proben von Mausgenen enthalten. Ein Set von acht Organen (Milz, Niere, Leber, Herz, Thymus, Gehirn, Pankreas und Muskelgewebe) von Mutanten- und Kontrolltieren werden von jeder Mauslinie im Primärscreen gesammelt. Organe für die Genexpressionsanalyse werden auf der Basis von auffälligen Phänotypen in anderen GMC Screens oder auf Grund bekannter Genfunktionen ausgewählt. Im Sekundärscreen werden Gewebe von Mauslinien analysiert, die nicht Bestandteil des Primärscreens sind oder veränderten Umweltbedingungen ausgesetzt wurden. Durch statistische Analysen werden signifikante Unterschiede in der Genexpression zwischen Mutante und Referenz identifiziert.



Weitere relevante Internt-Links:
The German Mouse Clinic