Genidentifizierung und Produktion von DNA-Konstrukten

Leitung:		Dr. Frank Buchholz
Institut:		Max Planck Institut für Molekulare Zellbiologie und Genetik (MPI-CBG)
Homepage:		www.mpi-cbg.de/research/research-groups/frank-buchholz.html

Das wissenschaftliche Ziel dieses Teilprojektes ist die Bereitstellung von funktionalen Daten für die Protein-Protein Interaktionsdaten via RNAi Studien. Hierbei sollen die effizienten und spezifischen endoribonuclease präparierten (e)siRNAs zum Einsatz kommen, die in NGFN2 weiter entwickelt wurden.

Die funktionale Charakterisierung wird auf drei Ebenen durchgeführt:

1.    Knockdown von Proteinkandidaten in existierenden und neu zu entwickelnden Assays zur Charakterisierung phänotypischer Konsequenzen.
2.    Bestimmung des Proteinkomplexaufbaus durch konsekutive Knockdowns  in Reporterzelllinien der generierten Proteinkomplexkomponenten.
3.    Knockdowns im großem Maßstab, um die globalen Änderungen der mRNA und Protein Landschaft nach Depletion zu studieren.
Diese funktionale Analyse wird auch zur Bewertung der studierten Proteinnetzwerke in Hinblick auf deren therapeutische Nutzbarkeit beitragen.



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